안녕하세요! 테라젠바이오 입니다!
오늘은 TCR Sequencing 진행 시 받아 보실 결과레포트에 대해 소개 드리겠습니다. 😊
테라젠바이오의 TCR Sequencing 레포트는 최적의 인사이트를 도출하실 수 있도록 다양한 분석 데이터를 제공하고, 논문 게재에 적합한 고해상도 Figure를 제공합니다.
레포트의 주요 Figure들에 대해 소개해드리겠습니다!
1) Clonal Proportion (Nucleotide / Amino Acid)
뉴클레오타이드 수준과 아미노산 수준에서 각각 클론타입의 비율을 제공합니다. (테이블 및 막대 그래프 형태로 제공됩니다.)
막대 그래프에서는 데이터 값이 낮을수록 아래에, 값이 높을수록 위에 배치됩니다. 값이 높아 위쪽에 위치할수록 해당 클론타입이 주요 클론타입임을 나타냅니다.
2) Clonal Proportion (Amino Acid) - Clonotype Clustering
샘플 내에서 우세하게 나타나는 아미노산 수준의 CDR3의 정보를 덴드로그램 (Dendrogram)과 함께 표시합니다.
* 상세 설명은 Report 설명서 참조
3) CDR3 Length Distribution
Sequence Logo Plot은 특정 위치에서 아미노산의 빈도를 시각적으로 나타내며, 빈도가 높을수록 글씨 크기가 더 크게 표시됩니다. 이는 해당 위치에서 특정 아미노산이 클론타입 내에서 주요하게 반복적으로 나타남을 의미합니다.
4) Gene Arrangement
Circos Plot을 통해 *V Gene과 *J Gene의 전체적인 결합 패턴을 확인할 수 있습니다.
Sankey Plot을 사용하여 상위 20개 클론타입의 결합 패턴을 시각적으로 확인할 수 있습니다.
* 예시레포트는 다운로드 후 이용해보실 수 있습니다.
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