안녕하세요. 테라젠바이오입니다 😊

#낮은 가격 #FFPE 고효율 #빠른 분석이 가능한 테라젠바이오 자체 개발

‘TCR 시퀀싱 서비스'를 소개합니다!

지난 뉴스레터와 TCR 시퀀싱 관련 논문이 궁금하시다면 아래 링크를 확인해주세요 :)

🔗 테라젠바이오 뉴스레터

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TCR 시퀀싱은 T 세포 수용체(T-cell Receptor, TCR)의 유전자 서열을 분석하여, T 세포가 특정 항원에 어떻게 반응하는지 연구하는 면역 프로파일링 기술입니다. 기존 TCR 시퀀싱은 #높은 가격 #FFPE 샘플 분석의 어려움 #긴 분석 시간 등의 한계를 가지고 있었는데요.

저희 테라젠바이오에선 이 단점을 어떻게 해결했는지 알려드릴게요 👀

📌 Point 1. 타사 대비 저렴한 가격

테라젠바이오는 TCR 라이브러리 키트와 분석 플랫폼을 모두 자체 개발하여, 상용 TCR 시퀀싱 서비스 중 가장 저렴한 가격으로 제공합니다.

테라젠바이오는 RNA 기반의 TCR 시퀀싱에서 다양성이 적은 불변부(Constant Region, C)을 타겟하는 Primer를 사용하여 cDNA를 합성하고, FR3 영역용 Primer Set를 최적화하여 비용을 최소화했습니다. 또한, 자체 개발한 분석 파이프라인을 활용해 기존 대비 50% 이하의 낮은 비용으로 고성능 TCR 시퀀싱 서비스를 제공합니다.

그림1. 테라젠바이오 TCR 시퀀싱 라이브러리 디자인
UMI(Unique Molecular Identifier)를 사용하여, 증폭 편향과 시퀀싱 에러를 최소화함.

📌Point 2. FFPE 샘플에서도 고효율 분석

테라젠바이오 TCR 시퀀싱 서비스는 PBMC뿐만 아니라 FFPE(Formalin Fixed and Paraffin Embedded)에서도 정확하고, 다양한 Clonotype 분석이 가능합니다. 기존 상용 TCR 시퀀싱 키트는 FFPE에서 라이브러리가 아예 제작이 되지 않거나, 분석 효율이 크게 저하되는 등의 한계가 있었습니다. 이를 해결하기 위해, 테라젠바이오는 Amplicon size를 최소화하는 등 Primer 디자인을 최적화하여, FFPE에서도 높은 효율로 분석할 수 있습니다.

그림 2. 타사 제품과의 FFPE 클론타입 비교

타사 제품으로는 검출이 불가한 FFPE 샘플에서도 테라젠바이오 TCR Assay는 다양한 클론타입 검출 가능

📌Point 3. 우수한 성능의 실험/분석

테라젠바이오의 TCR 시퀀싱 서비스는 자체 개발한 TCR Assay와 분석 플랫폼을 기반으로, 합리적인 가격과 함께 뛰어난 성능을 제공합니다. 테라젠바이오의 독자적인 기술력은 타사 대비 다양한 클론타입을 식별할 수 있으며, 우수한 분석 정확도를 자랑합니다. 

그림 3. 타사 제품과의 PBMC 클론타입 비교(왼쪽), 분석 플랫폼별 정확도 성능 비교(오른쪽)

PBMC에서 타사 제품과 비교한 결과, 현저히 높은 클론타입 수와 다양성 그리고 일관성 확인(왼쪽)

시뮬레이션 데이터에서 V(D)J 서열 재조합 예측값과 정답을 비교한 결과, 90% 이상의 정확도 확인(오른쪽)