테라젠바이오의 Bacterial Whole Genome de novo Assembly 레포트는 최적의 인사이트를 도출하실 수 있도록 다양한 분석 데이터를 제공하고, 논문 게재에 적합한 고해상도 Figure를 제공합니다.
레포트의 주요 Figure들에 대해 소개해드리겠습니다!
1) Circos Plot - Summary
그림 1. Bacterial Whole Genome de novo Assembly 전체 분석 요약
Circos 플롯에는 CDS, rRNA, tRNA, GC Contents, 그리고 GC Skew가 포함된 트랙이 있습니다.
여기서 제공된 Circos Plot은 박테리아 유전체를 포괄적으로 시각화 합니다.
* 상세 설명은 Report 설명서 참조
2) Functional Annotation
그림 2. Functional Annotation 결과
*COG(Clusters of Orthologous Groups)에 *Functional Annotation이 추가되었습니다.
*COG는 진화적으로 공통 조상을 가진(Orthologous) 유전자들을 기능적으로 그룹화한 시스템입니다. 이를 통해 유전자 기능별 분포를 비교하고, 특정 생물체나 조건에서 활성화되는 기능을 분석할 수 있습니다. *Functional Annotation은 각 COG가 어떤 생물학적 기능을 수행하는지 정보를 부여하는 과정으로, 이를 통해 특정 유전자들이 어떤 역할을 하는지 파악할 수 있습니다.
* 상세 설명은 Report 설명서 참조
3) Functional Analysis - AMR, HGT, Virulence
그림 3. Functional Analysis 결과 - Virulence
이 섹션은 병원성 유전 인자에 대한 테이블을 보여줍니다. 병원성 인자는 VFDB와 VirulenceFinder를 통해 검색되었습니다. 분석을 통해 병원성 세균의 특성을 보다 정밀하게 파악할 수 있습니다.
AMR과 HGT 데이터도 테이블 형태로 제공합니다.
* 상세 설명은 Report 설명서 참조
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