테라젠바이오 Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스를 소개합니다! 안녕하세요, 테라젠바이오입니다! 😄
오늘은 테라젠바이오가 새롭게 리뉴얼한,
Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스를 소개해드릴게요.
이 서비스는 박테리아의 전체 유전체를 분석하는 기술로, 기존의 참조 유전체(Reference Genome)가 없는 경우에도 유전체의 완전한 구조를 복원할 수 있습니다.
또한, Long Read와 Short Read 기술을 각각 활용할 수 있으며, 두 기술을 결합한 Hybrid 접근 방식도 가능합니다. 아울러, AMR(Anti-Microbial Resistance, 항생제 내성), HGT(Horizontal Gene Transfer, 수평적 유전자 전달), Virulence(병원성) 분석을 동시에 제공합니다.
이를 통해 타사 대비 뛰어난 경쟁력을 보유하고 있으며, 더욱 신뢰할 수 있는 고품질 유전체 데이터를 제공합니다.
자세한 사항은 아래에서 설명 드리겠습니다!
지난 테라젠바이오 뉴스레터에 대해 궁금하신 분들은 아래 링크를 통해 확인해주세요!
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한눈에 비교하는 테라젠바이오의
Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스 강점 |
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📌 왜 Bacterial Whole Genome de novo Assembly가 필요할까요?
Bacteria는 환경 변화에 빠르게 적응하며 유전적 다양성을 확보하는 생물로, 이를 이해하기 위해 유전체 분석이 필수적입니다. 특히, Species 수준에서 동일한 Reference를 가지고 있더라도 HGT 등의 현상으로 Strain 간의 유전적 차이가 크게 나타날 수 있습니다. 따라서, 기존의 Reference Mapping 방식만으로는 이러한 변이를 정확히 분석하기 어려우며, 보다 정밀한 분석을 위해 Bacterial Whole Genome de novo Assembly가 필요합니다 (그림 1).
이에 테라젠바이오는 Long Read와 Short Read 기술을 각각 활용하거나 결합(Hybrid)하고, 최적화된 Assembler를 적용하여 Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스를 제공합니다. 이를 통해 연구자들이 보다 효율적으로 분석할 수 있도록 지원합니다. |
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그림 1. Bacteria 유전체 분석에서 기존 Read Mapping 방식의 한계
기존의 Read Mapping 방법은 Small Indel 및 SNV 변이를 탐지하는 데 효과적이지만 (왼쪽), Species 수준에서 동일한 Reference를 갖고 있더라도 HGT 등의 현상으로 Strain 간 유전적 차이가 크게 나타나는 Bacteria에서는 한계가 있습니다 (오른쪽).
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📌 연구자 중심의 자동화된 분석 레포트
테라젠바이오가 자체 개발한 자동화 분석 파이프라인과 직관적인 분석 레포트를 통해 높은 신뢰성과 재현성을 갖춘 결과를 제공합니다. 또한, 분석 결과를 모두 시각화하여 논문 및 보고서에 즉시 활용할 수 있는 Publication Ready Figure 및 Table을 함께 제공합니다 (그림 2,3,4).
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그림 2. Bacterial Whole Genome de novo Assembly 전체 분석 요약
Circos 플롯에는 CDS, rRNA, tRNA, GC Contents, 그리고 GC Skew가 포함된 트랙이 있습니다.
여기서 제공된 Circos Plot은 박테리아 유전체를 포괄적으로 시각화 합니다.
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그림 3. Functional Annotation
*COG(Clusters of Orthologous Groups)에 *Functional Annotation이 추가되었습니다.
*COG는 진화적으로 공통 조상을 가진(Orthologous) 유전자들을 기능적으로 그룹화한 시스템입니다. 이를 통해 유전자 기능별 분포를 비교하고, 특정 생물체나 조건에서 활성화되는 기능을 분석할 수 있습니다.
*Functional Annotation은 각 COG가 어떤 생물학적 기능을 수행하는지 정보를 부여하는 과정으로, 이를 통해 특정 유전자들이 어떤 역할을 하는지 파악할 수 있습니다.
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그림 4. Functional Analysis 결과 - AMR, HGT, Virulence
AMR 유전자에 대한 테이블을 제공합니다. 항생제 내성 유전자를 탐지하고 내성 기작을 분석하는 AMR Finder, RES Finder, CARD의 결과를 포함합니다. 여기에는 AMR 유전자 패밀리, 저항 기전, 항생제 등의 정보가 포함되어 있습니다.
Virulence와 HGT 데이터도 테이블 형태로 제공합니다. |
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Long Read와 Short Read 기술을 각각 활용하거나 결합(Hybrid)하여
박테리아의 전체 유전체를 분석하는
Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스
아래 예시 레포트를 클릭하거나 ‘서비스 문의’ 버튼 또는 이메일을 통해 문의 주시면
더욱 자세히 안내 드리겠습니다. 😉
📌 테라젠바이오 Bacterial Whole Genome de novo Assembly 서비스
* 예시레포트는 링크 클릭 후 다운로드하여 확인 가능하십니다.
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