(AD) [테라젠바이오] 다양한 연구 사례로 입증된 Long Read Sequencing, 최신 논문으로 지금 확인해보세요!

Long Read Sequencing을 활용한 다양한 연구 사례의 최신 논문들을 알아보겠습니다.

2024. 12. 5.

안녕하세요, 테라젠바이오입니다. 😊

현재 테라젠바이오에서는 연말 프로모션이 진행 중인데요,

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이번 포스팅에서는 연말 프로모션 주요 항목 중 하나인 Long Read Sequencing 기술을 활용해 Genome Research 저널 Long Read 특별호에 실린 연구들을 소개합니다. 이번 특별호는 최근 Long Read Genome 및 RNA Sequencing 기술이 다양한 분야에서 활발히 활용되고 있음을 보여주는 대표적인 사례로, 해당 기술을 활용한 최신 연구 결과들을 한눈에 확인할 수 있습니다.

특히, Long Read Sequencing은 기존 기술로는 해결하기 어려웠던 다양한 유전체 연구 과제를 효과적으로 해결하며, 연구자들에게 필수적인 도구로 자리 잡고 있습니다. 특별호에 담긴 다양한 논문을 통해 Long Read Sequencing 기술의 광범위한 활용 사례를 만나보세요.

논문 리스트와 자세한 내용은 아래 링크에서 확인 가능합니다! 😊

▲ Genome Research Long-read DNA and RNA Sequencing Special Collection November 2024, 34 (11)

📌 Review

> Iyer SV, et al. Leveraging the power of long reads for targeted sequencing.

Long Read Sequencing 기술을 활용한 타겟 시퀀싱의 장점을 탐구한 연구입니다.

> Belchikov N, et al. Understanding isoform expression by pairing long-read sequencing with single-cell and spatial transcriptomics.

단일 세포 및 공간 전사체 분석과 Long Read Sequencing을 결합해 Isoform 발현을 분석한 연구입니다.

> Calvo-Roitberg E, et al. Challenges in identifying mRNA transcript starts and ends from long-read sequencing data.

Long Read Sequencing 데이터를 활용한 mRNA 전사체의 시작점과 종결점을 파악하는 데 직면한 과제를 탐구한 연구입니다.

📌 Research

> Hiatt SM, et al. Long-read genome sequencing and variant reanalysis increase diagnostic yield in neurodevelopmental disorders.

Long Read Genome Sequencing과 변이 재분석을 통해 신경발달장애의 진단율을 높인 연구입니다.

> Eisfeldt J, et al. Resolving complex duplication variants in autism spectrum disorder using long-read genome sequencing.

Long Read Genome Sequencing을 통해 자폐 스펙트럼 장애에서 복잡한 중복 변이를 분석한 연구입니다.

> Eisfeldt J, et al. A national long-read sequencing study on chromosomal rearrangements uncovers hidden complexities.

Long Read Sequencing 기반의 대규모 연구에서 염색체 재배열의 복잡성을 규명한 연구입니다.

> Bilgrav Saether K, et al. Leveraging the T2T assembly to resolve rare and pathogenic inversions in reference genome gaps.

T2T assembly를 활용해 참조 유전체의 결손 영역에서 드문 병원성 역위를 분석한 연구입니다.

> Guitart X et al. Independent expansion, selection, and hypervariability of the TBC1D3 gene family in humans.

인간에서 TBC1D3 유전자 군의 독립적 확장, 선택, 및 초변이를 탐구한 연구입니다.

> de Groot N, et al. Unraveling the architecture of major histocompatibility complex class II haplotypes in rhesus macaques

레서스 마카크(붉은털원숭이)에서 주요 조직 적합성 복합체(MHC) 클래스 II 하플로타입의 구조를 분석한 연구입니다.

> Pacholewska A, et al. Long-read transcriptome sequencing of CLL and MDS patients uncovers molecular effects of SF3B1 mutations

CLL과 MDS 환자에서 Long Read RNA Sequencing 을 통해 SF3B1 돌연변이의 분자적 영향을 규명한 연구입니다.

> Lee J, et al. Long-read RNA sequencing of archival tissues reveals novel genes and transcripts associated with clear cell renal cell carcinoma recurrence and immune evasion

보관된 조직의 Long Read RNA Sequencing을 통해 투명 세포 신장암 (clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)의 재발 및 면역 회피와 관련된 새로운 유전자와 전사체를 발견한 연구입니다.

> Volarić M, et al. Long-read genome assembly of the insect model organism Tribolium castaneum reveals spread of satellite DNA in gene-rich regions by recurrent burst events

곤충 모델 생물인 거짓쌀도둑거저리(Tribolium castaneum)의 Long Read Genome Assembly를 통해 유전자 풍부 영역에서 위성 DNA가 반복적 폭발 이벤트로 확산된 것을 밝혀낸 연구입니다.

> Gomez-Simmonds A, et al. Genomic epidemiology of carbapenem-resistant Enterobacterales at a New York City hospital over a 10-year period reveals complex plasmid-clone dynamics and evidence for frequent horizontal transfer of blaKPC

뉴욕시 병원의 카바페넴 내성 장내세균에 대한 10년간의 유전체 역학 연구를 통해 blaKPC의 빈번한 수평적 전이와 복잡한 플라스미드-클론 동태를 규명한 연구입니다.

📌 Methods

> Tesi N, et al. Characterizing tandem repeat complexities across long-read sequencing platforms with TREAT and otter

TREAT와 otter 도구를 사용해 Long Read Sequencing 플랫폼에서 반복 서열(tandem repeat)의 복잡성을 분석한 연구입니다.

> Ritter AJ, et al. Long-read subcellular fractionation and sequencing reveals the translational fate of full-length mRNA isoforms during neuronal differentiation

Long Read 기반 세포 소기관 분획 분석과 시퀀싱을 통해 신경 세포 분화 동안 full-length mRNA Isoform의 번역 운명을 규명한 연구입니다.

> Jagannatha P, et al. Long-read Ribo-STAMP simultaneously measures transcription and translation with isoform resolution

Long Read Ribo-STAMP 기술을 활용해 Isoform 수준의 해상도로 전사와 번역을 동시에 측정한 연구입니다.

> Slizovskiy IB, et al. Factors impacting target-enriched long-read sequencing of resistomes and mobilomes

내성 유전체(resistomes)와 이동 유전체(mobilomes)의 target-enriched Long Read Sequencing에 영향을 미치는 요인을 분석한 연구입니다.

📌 테라젠 바이오 Long Read Sequencing 서비스 레포트

- Long Read Genome Sequencing 브로셔
- Long Read Genome Sequencing 예시레포트

- Long Read Genome Sequencing 예시레포트 설명서

- Long Read RNA Sequencing 브로셔
- Long Read RNA Sequencing 예시레포트

- Long Read RNA Sequencing 예시레포트 설명서

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테라젠바이오는 국내 700여 의료 기관들과 해외 40여개국 연구 기관들을 대상으로 유전체 분석 서비스를 제공하며, 4세대 개인맞춤형 항암신약(NeoAntigen cancer vaccine) 개발을 전문으로 하는 바이오 기업입니다. 테라젠바이오는 2009년 테라젠이텍스 내의 바이오연구소로 처음 설립됐으며, 이후 10여년간 누적된 세계적 역량들을 기반으로 Therapeutics R&D라는 제2의 도약을 이루기 위해 2020년 5월 테라젠바이오라는 독립 법인으로 승격되었습니다. 테라젠바이오는 유전체 기술을 기반으로 맞춤의학을 실현하고, 이를 통해 인류 복지와 건강에 참된 희망과 실질적인 솔루션을 제공하고자 합니다.