안녕하세요. 테라젠바이오입니다 😊

#낮은 가격 #FFPE 고효율 #빠른 분석이 가능한 ‘TCR 시퀀싱 서비스'를 신규 런칭했습니다!

TCR 시퀀싱은 T 세포 수용체(T-cell Receptor, TCR)의 유전자 서열을 분석하여, T 세포가 특정 항원에 어떻게 반응하는지 연구하는 면역 프로파일링 기술입니다. 기존 TCR 시퀀싱은 #높은 비용 #긴 소요시간 #FFPE에서 분석이 어렵다는 단점을 가지고 있었는데요.

저희 테라젠바이오에선 이 단점을 어떻게 해결했는지 알려드릴게요 👀

Point 1. 타사 대비 가장 저렴한 가격

테라젠바이오는 TCR 라이브러리 키트와 분석 플랫폼을 모두 자체 개발하여, 상용 TCR 시퀀싱 서비스 중 가장 저렴한 가격으로 제공합니다.

TCR 시퀀싱 방법은 샘플에 따라 크게 DNA, RNA 기반 방법으로 나눌 수 있는데요. 테라젠바이오에선 RNA 기반 방법 중, 상대적으로 다양성이 적은 불변부(Constant Region, C)를 타겟하는 Primer를 사용하여 Targeted cDNA를 합성하고, FR3 영역을 타겟하는 Primer Set를 최적화하여 시퀀싱 비용을 최소화했습니다. 또한, 높은 라이선스 비용이 요구되는 MiXCR 분석 소프트웨어 대신 자체 개발한 분석 파이프라인을 활용하여, 기존 방법 대비 50% 이하의 낮은 비용으로 우수한 성능의 TCR 시퀀싱 서비스를 제공할 수 있게 되었습니다.

그림1. 테라젠바이오 TCR 시퀀싱 라이브러리 디자인
UMI(Unique Molecular Identifier)를 사용하여, 증폭 편향과 시퀀싱 에러를 최소화함.

Point 2. FFPE 샘플에서도 고효율 분석

테라젠바이오 TCR 시퀀싱 서비스는 PBMC뿐만 아니라 FFPE(Formalin Fixed and Paraffin Embedded)에서도 정확하고, 다양한 Clonotype 분석이 가능합니다. 기존 상용 TCR 시퀀싱 키트는 FFPE에서 라이브러리가 아예 제작이 되지 않거나, 분석 효율이 크게 저하되는 등의 한계가 있었습니다. 이를 해결하기 위해, 테라젠바이오는 Amplicon size를 최소화하는 등 Primer 디자인을 최적화하여, FFPE에서도 높은 효율로 분석할 수 있습니다.

그림 2. FFPE에서 Clontype 다양성 비교

동일한 FFPE 샘플(Lymphnode, Spleen, Tonsil)에서 Unique Clonotype의 수를 비교한 결과. 테라젠바이오 서비스가 기존 TCR 시퀀싱 키트보다 1.4배에서 3배 다양한 TCR Clonotype이 확인됨.

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